Mijn onderzoek richt zich op de symbiose tussen sponzen en microben en hun vermogen om natuurlijke producten te produceren als onderdeel van het Europees MARBLES project. Sponzen staan erom bekend dat ze een enorme verscheidenheid aan natuurlijke producten produceren. Door het bestuderen van de functionele diversiteit van microben in hun gastheer uit verschillende ecosystemen zoals de diepzee en koraalriffen, kunnen we de meest veelbelovende ecosystemen aanwijzen om duurzaam nieuwe natuurlijke producten uit marine ecosystemen te isoleren en daarmee dus de zoektocht naar bijvoorbeeld nieuwe antibiotica beter te geleiden.
Sleutelwoorden
Sponzen, Marine Biodiversiteit, Moleculaire Biologie, Microbiële gemeenschappen, Genomics, Ecologie, Taxonomie, Natural Products
Onderzoekinteresse
Mijn interesse ligt bij sponzen en hun complexe interacties met symbiotische microben en hun omgeving. Door een verscheidenheid van technieken te gebruiken bestudeer ik de functionele microbiële diversiteit en de diversiteit van biosynthetic gene clusters.
Al vroeg tijdens mijn studie raakte ik geïnteresseerd in marine biologie, met name in sponzen. Ik raakte gefascineerd door hun simpele lichaamsbouw, maar tegelijkertijd complexe interacties met hun omgeving en hun belang voor het functioneren van het ecosysteem. Tijdens verschillende onderzoeken heb ik gewerkt aan spons taxonomie, ecologie en genetica.
Voor mijn PhD project gebruik ik een verscheidenheid van technieken door het combineren van metabarcoding, metagenomics en metatranscriptomics om de functionele microbiële diversiteit en biosynthetic gene cluster diversiteit te onderzoeken. Door dit te doen, hoop ik de meest veelbelovende ecosystemen voor het ontdekken van nieuwe natuurlijke producten in kaart te brengen.
Currenttopics
Mijn onderzoek richt zich op:
- Biodiversiteit van marine sponzen en hun symbionten
- Onderzoeken van microbiële gemeenschappen in sponzen op een globaal niveau
- Linken van microbiële gemeenschappen met de biosynthetic gene cluster diversiteit
- In kaart brengen van de invloed van omgevingsfactoren op de microbiële gemeenschappen en gen expressie
Marine biodiversity
MARBLES Bruikbare moleculen uit de zee
Keypublications
- van der Windt, N., van der Ent, E., Ambo-Rappe, R., & de Voogd, N. J. (2020). Presence and Genetic Identity of Symbiodiniaceae in the Bioeroding Sponge Genera Cliona and Spheciospongia (Clionaidae) in the Spermonde Archipelago (SW Sulawesi), Indonesia. Frontiers in Ecology and Evolution, 8.
In demedia
- In 2018 is onze groep op veldwerk gegaan naar de Spermonde eilanden in Indonesië. Deze video is gemaakt om ons werk in het veld te laten zien
