Angelica Cibrian Jaramillo

Ik ben een evolutionair bioloog en botanicus. Ik onderzoek de processen die ten grondslag liggen aan ecologische patronen bij planten. Hoe passen planten zich aan, aan hun veranderende landschap? Wat is de rol van symbionten in hun aanpassing? En de rol van mensen? Ik gebruik ecologische en evolutionaire genomica binnen een integratief taxonomisch kader om deze vragen te beantwoorden.

Keywords

Ecologische genomica, integratieve taxonomie, fylogenomica, microbiomen, cycaden, CWR's, interdisciplinair onderzoek.

With Dioon thousand-yeard old plants in the wild

Onderzoeksinteresse

Ik onderzoek hoe planten zich aanpassen aan hun lokale landschappen, inclusief landschappen die zijn getransformeerd door mensen. Ik werk aan cycaden en gewassen met wilde verwanten. Cycaden zijn een opkomend model voor plantonderzoek. Ik gebruik genomica en integratieve taxonomie om te onderzoeken hoe ze co-evolueren en zich aanpassen aan hun landschap. Ze zijn wereldwijd de meest bedreigde planten, dus ik onderzoek ook hun etnografie en conservatie. Wat betreft gewassen met wilde verwanten, wil ik hun taxonomie begrijpen, hun oorsprong, hun reis van de tropen naar Europa, en de genetische mechanismen die ten grondslag liggen aan hun transformatie tot gewassen voor mensen.

Chili pepper fruits (Capsicum annuum var. glabriusculum)

Actuele
onderwerpen

Kom met me mee om planten hun evolutionaire geschiedenis te ontdekken en te beschrijven.

Overleven van Uitsterven: Genomische inzichten in de veerkracht van cycaden

Een van de belangrijkste wetenschappelijke vragen in onze tijd is wat bepaalde groepen organismen in staat stelt om zich aan te passen aan door de mens veroorzaakte milieu- en klimaatveranderingen, terwijl andere uitsterven? Het antwoord op deze vraag is…

Lees meer

Cyanobacteriën (blauwe stippen) binnenin de koraalachtige wortel van de cycade

Microbiële plantensymbionten

Cycaden hebben zich aangepast aan extreme habitats waar andere planten nauwelijks kunnen overleven, zoals rotsuitstulpingen of zoute duinen. We denken dat microbiomen die binnenin gespecialiseerde wortels van de cycade leven, cruciaal zijn voor deze…

Lees meer

Genomica van gewassen en hun wilde verwanten

In dit onderzoeksgebied karakteriseren we de taxonomie en genetische variatie bij wilde verwanten van gewassen en zoeken we naar genomische mechanismen die wilde planten in staat stellen om gewassen te worden tijdens menselijke selectie.

Lees meer

Belangrijke
publicaties

Bustos-Diaz E.D., Cruz-Perez, A., Garfias-Gallegos, D.; D'Agostino, P.M.; Gehringer M.M., Cibrian Jaramillo A., Barona-Gomez, F. Phylometagenomics of cycad coralloid roots reveals shared symbiotic signals. Accepted Microbial Genomics. DOI 10.1099/mgen.0.001207.
Gutierrez-García, K., Whitaker M.R.L., Bustos-Díaz, E.D., Salzman S.,Ramos-Aboites, H.E., Reitz Z.L., Pierce N.E., Cibrian-Jaramillo, A., Barona-Gómez, F. 2023. Gut microbiomes of cycad-feeding insects tolerant to β-methylamino-L-alanine (BMAA) are rich in siderophore biosynthesis. ISME Communications (3). www.nature.com/articles/s43705-023-00323-8#citeas.
Díaz-Valenzuela, E., Hernández-Ríos, D. & Cibrián-Jaramillo, A. 2023. The role of non-additive gene action on gene expression variation in plant domestication. EvoDevo 14, 3. https://doi.org/10.1186/s13227-022-00206-4.
Dunn RR, Burger JR, Carlen EJ, Koltz AM, Light JE, Martin RA, Munshi-South J, Nichols LM, Vargo EL, Yitbarek S, Zhao Y and Cibrian-Jaramillo A. 2022. Urban Archipelagos: A Theory of City Biogeography and the Origin of Species. Frontiers in Conservation Science. Vol 3.
Under the Shade of Thipaak: The Ethnoecology of Cycads in Mesoamerica and the Caribbean. 2022. Carrasco M.D., Cibrián-Jaramillo A.*, Bonta M.A., Englehardt J.E. (editors), University Press of Florida. 342pp. 2023 Society for Ethnobotany Daniel F. Austin Award.
Díaz-Valenzuela E., Sawers, R.H., Cibrian-Jaramillo, A*. 2020. Cis- and Trans-Regulatory Variations in the Domestication of the Chili Pepper Fruit, Molecular Biology and Evolution (37) 6: 1593–1603.
Gutierrez-Garcia, K. Bustos-Diaz, E.D., Corona-Gómez, J.A., Ramos-Aboites H.E., Selem-Mojica, N., Cruz-Morales P., Perez-Farrera, M.A., Barona-Gomez, F. Cibrian-Jaramillo, A*. 2019. Cycad Coralloid Roots Contain Bacterial Communities Including Cyanobacteria and Caulobacter spp. That Encode Niche-Specific Biosynthetic Gene Clusters. Genome Biology and Evolution 11(1): 319–334.
Bonta M., Pulido-Silva M.T., Diego-Vargas T., Vite-Reyes A., Vovides A.P., Cibrian-Jaramillo A*. 2019. Ethnobotany of Mexican and northern Central American cycads (Zamiaceae). Journal of Ethnobiology and Ethnomedicine (15) 4. https://doi.org/10.1186/s13002-018-0282-z.